L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

CONTEXTE SCIENTIFIQUE

Le GFLV est une menace majeure pour la viticulture mondiale. Présent dans le monde entier et touchant les 2/3 du vignoble français, il peut causer jusqu'à 80% de pertes de rendement. L'interdiction des nématicides ciblant son nématode vecteur, Xiphinema index, a laissé peu de solutions aux viticulteurs pour lutter contre ce virus.

La protection croisée - ou prémunition - est une méthode de biocontrôle visant à protéger les plantes des dommages causés par les virus pathogènes. Cette stratégie qui consiste à inoculer un ou plusieurs variants primaires peu virulents pour prévenir une infection ultérieure par des souches virulentes apparentées a été décrite pour la première fois en 1929 sur le tobacco mosaic virus. Bien que ce phénomène ait été mis en évidence pour la première fois il y a près d'un siècle, le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) reste(nt) mal compris. Nos travaux visent à la fois à développer la prémunition contre le GFLV au vignoble afin d'offrir aux viticulteurs une solution respectueuse de l'environnement et à comprendre le(s) mécanisme(s) sous-jacent(s) à ce phénomène.

VOS MISSIONS

Cette offre de poste s’inscrit dans la dynamique des travaux de recherche associée au projet Vaccivine2 financé de 2022 à 2027 par le Plan National du Dépérissement du Vignoble (coordination Emmanuelle Vigne).

Vous serez amené.e à : i) distinguer les variants du GFLV par analyses moléculaires à partir de vignes infectées provenant du vignoble; ii) analyser à l’aide de logiciels les résultats des séquences nucléotidiques ; iii) analyser, synthétiser et mettre en forme les résultats. Afin d’éviter les contaminations, vous respecterez les règles de marche en avant qui permettent de dissocier quatre étapes majeures (broyage des échantillons, extraction d’acides nucléiques, pré-PCR, post-PCR).

• Formation recommandée : BAC+3 (BTS, DUT, Licence professionnelle)
• Connaissances et compétences souhaitées : virologie, biologie moléculaire (design de primers, RT-PCR, synthèse de librairies, analyses de séquences Sanger et Minion, phylogénie).
• Aptitudes recherchées : rigueur, précision, autonomie, motivation, bonnes capacités relationnelles.