Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Nous recherchons un chercheur en biologie computationnelle possédant une expérience en apprentissage automatique ou en modélisation fondée sur les données, et souhaitant aborder des questions fondamentales en biologie des protéines.
La personne recrutée développera et appliquera des approches computationnelles afin d’étudier les protéines intrinsèquement désordonnées, les interactions protéiques, les condensats biomoléculaires, ainsi que leurs rôles dans l’organisation cellulaire et les maladies.


Activités :
1. Mener des recherches computationnelles, du développement méthodologique à la diffusion des résultats
- Développer et appliquer des méthodes d’apprentissage automatique et des approches fondées sur les données pour l’analyse des protéines.
- Intégrer et analyser à grande échelle des données de séquence, de structure, d’interaction, d’évolution et de biophysique des protéines.
- Étudier comment les propriétés de séquence et les propriétés conformationnelles des protéines intrinsèquement désordonnées déterminent leurs interactions, la condensation biomoléculaire et leurs fonctions cellulaires.
- Collaborer avec des chercheurs expérimentateurs afin de générer des hypothèses, de hiérarchiser les prédictions et de soutenir leur validation expérimentale.
- Contribuer à des publications, des présentations, des logiciels et des ressources computationnelles.

2. Contribuer aux activités du laboratoire
- Participer aux réunions de l’équipe et aux activités scientifiques de l’institut.
- Contribuer aux projets collaboratifs menés au sein de l’équipe de recherche.
- Participer, le cas échéant, à l’encadrement d’étudiants et de stagiaires.

Contexte de travail :
Le poste est proposé au sein de l’équipe Protein Disorder and Cellular Function du Centre de Recherche en Biologie cellulaire de Montpellier (CRBM, CNRS–Université de Montpellier).
L’équipe développe des approches computationnelles pour étudier les protéines intrinsèquement désordonnées et leurs rôles dans les interactions protéiques, l’organisation cellulaire, les condensats biomoléculaires et les maladies. Ses recherches associent apprentissage automatique, analyse de données à grande échelle, modélisation biophysique et validation expérimentale.
L’équipe possède une expertise reconnue dans le développement de méthodes computationnelles consacrées aux protéines intrinsèquement désordonnées et a contribué à plusieurs outils largement utilisés pour la prédiction du désordre protéique et des régions de liaison désordonnées.
Le CRBM est un institut de recherche multidisciplinaire et international disposant d’expertises et de plateformes en biologie computationnelle, biologie cellulaire, imagerie, protéomique, biologie structurale et biophysique.
La personne recrutée sera employée par le CNRS dans le cadre d’un contrat à durée déterminée à temps plein de 24 mois, avec possibilité de prolongation.
La langue de travail du laboratoire
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Les candidats devront posséder :
- Un doctorat en bioinformatique, biologie computationnelle, informatique, biophysique, statistiques, mathématiques appliquées ou dans une discipline connexe.
- Une expérience en apprentissage automatique, modélisation statistique ou recherche computationnelle fondée sur les données.
- De solides compétences en programmation scientifique, de préférence en Python.
- Une expérience du développement et de l’évaluation de méthodes computationnelles, ainsi que de l’analyse de jeux de données complexes.
- Un intérêt pour la biologie des protéines et la capacité à travailler de manière autonome et collaborative.
- Une bonne maîtrise de l’anglais écrit et oral.

Une expérience dans un ou plusieurs des domaines suivants constituerait un atout :
- Apprentissage profond, modèles de langage protéique, apprentissage de représentations ou modélisation générative.
- Bioinformatique des séquences ou des structures protéiques.
- Protéines intrinsèquement désordonnées, motifs linéaires courts ou condensats biomoléculaires.
- Développement logiciel, calcul haute performance ou analyse de données à grande échelle.

Contraintes et risques :
Aucune