Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :

Ce postdoctorat s'inscrit dans le cadre du projet collaboratif "Cone-Beam AI" entre Acteon, une entreprise spécialisée dans la conception de dispositifs médicaux à base de rayons X pour le secteur dentaire, le centre de recherche en acquisition et traitement de l'image pour la Santé (CREATIS) et l'institut de mathématiques de Bordeaux (IMB).

L'objectif principal de ce projet de recherche est d'améliorer la qualité des tomodensitométries à faisceau conique (CBCT, de l'anglais cone-beam computed tomography) utilisées en imagerie dentaire pour le diagnostic, tout en réduisant la dose de radiation reçue par les patients. Pour y parvenir, le postdoctorant aura pour mission de développer de nouveaux algorithmes de reconstruction tomographique plus performants en utilisant notamment des méthodes d'apprentissage automatique adaptées à la résolution de problèmes inverses.

Activités :

En collaboration avec les autres membres du projet, les activités du postdoctorant porteront sur les sujets suivants :

- reconstruction CBCT à partir de données tronquées : le but est d'arriver à une reconstruction quantitative dans le champ de vue du scanner et aussi bonne que possible hors du champ de vue.

- correction de mouvements : les mouvements involontaires du patient ou du scanner pendant l'acquisition induisent des artéfacts qu'on peut corriger à partir d'une estimation du mouvement. L'objectif sera ici d'estimer ce mouvement sans passer par une reconstruction préalable à partir d'équations mathématiques connues sous le nom de conditions de cohérence des données.

- rayonnement diffusé : la reconstruction CBCT suppose que le rayonnement diffusé n'est pas mesuré, ce qui n'est pas le cas et dégrade fortement les images CBCT. L'objectif sera de corriger les projections rayons X en estimant ce rayonnement diffusé par une estimation basée sur un apprentissage profond.

- artéfacts métalliques : les métaux dans le champ de vue induisent une dégradation importante de la qualité d'image pouvant polluer le diagnostic qui pourraient également être corrigés dans les projections par apprentissage profond.

Contexte de travail :

Supervision : Simon Rit

Localisation : principalement au centre Léon Bérard, Lyon, France.

Durée : 14 mois, démarrage dès que possible.

CREATIS est un laboratoire multidisciplinaire possédant un large spectre de compétences en imagerie médicale et jouant un rôle majeur dans le domaine des technologies de la santé. Le candidat intégrera l'équipe tomoradio, en particulier le groupe localisé au centre de lutte contre le cancer Léon Bérard.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :

Académique : doctorat en mathématiques appliquées, informatique ou physique médicale,

Centres d'intérêt scientifiques : mathématiques appliquées, informatique (traitement d'images médicales), physique médicale,

Compétences informatiques : Python, C++ (ITK, RTK),

Langues : anglais obligatoire, français optionnel.

Contraintes et risques :