Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Dans le cadre d'un projet ANR impliquant l'équipe de microscopies avancées des tissus du Laboratoire Optique et Biosciences (LOB) à l’École polytechnique et le groupe de neurogenèse et développement de circuits de l'Institut de la Vision (IDV), nous sommes a la recherche d'un ou une chercheur post-doctorant pour travailler sur la simulation informatique du développement des connexions du noyau médian du corps trapézoïde (Medial Nucleus of the Trapeziod Body, MNTB), un relais auditif de la souris. Il/elle aura pour mission de regrouper ce qui est connu des différents mécanismes impliqués dans ce processus dans une plateforme de simulation informatique, et l'utiliser pour explorer les hypothèses faites et comprendre des données complexes acquises dans le projet par ailleurs.
Activités :
- Comprendre finement l'état des connaissances sur le développement du MNTB et de ses connexions au Noyaux Cochléaire (Cochlear Nucleus, CN) et faire l'état de l'art des nombreux efforts en simulation du développement du cerveau
- Développer une plateforme de simulation sur la base de ces efforts existants qui récapitule le développement de la connexion entre le CN et le MNTB
- Explorer ces simulations et les différents mécanismes et hypothèses proposés, pour comprendre comment deux types de contraintes, topologique et topographique, sont satisfaites. On pourra en particulier utiliser les méthodes récentes d'apprentissage statistique pour la simulation.
- Faire les liens avec la partie expérimental du projet qui fournira des données uniques de micro-connectomique
Contexte de travail :
Le poste est localisé au LOB à Palaiseau mais avec de forts liens avec l'équipe de Jean Livet à l'IDV. Il sera partie intégrante d'un effort interdisciplinaire impliquant biologistes expérimentaux et computationnels, physiciens et spécialistes de l'analyse de donnée. Il prend appuis sur le développement de technologies d'imagerie permettant d'étudier le développement des tissus cérébraux via la cartographie avec une résolution subcellulaire 3D de volume allant jusqu’à un cerveau de souris entier marqué par une approche Brainbow multicolore.

Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Le/la candidat idéal aurait de l'expérience dans la modélisation de systèmes biologiques complexes, idéalement en neurosciences, de très bonnes compétences de programmation en python et un esprit ouvert prêt à être intégré dans une collaboration très interdisciplinaire. Des connaissances et/ou un intérêt pour l'apprentissage automatique et l'analyse d'images/données seraient un plus.
Contraintes et risques :