L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Vous exercerez votre activité au sein de l’équipe Immunocare appartient à l’unité mixte de recherche BIOEPAR (INRAE-Oniris), spécialisée dans l’étude des maladies infectieuses des animaux d’élevage et leurs impacts sur la santé et les systèmes d’élevage.

L’équipe est organisée en deux groupes de recherche dont les travaux portent respectivement sur la santé respiratoire des porcs et des bovins. Elle développe des approches innovantes visant à mieux comprendre les interactions entre agents pathogènes et système immunitaire afin d’améliorer les stratégies de prévention et de vaccination.

La personne recrutée rejoindra le groupe dirigé par le Dr Nicolas Bertho, composé de deux chercheurs INRAE, d'un.e enseignant.e-chercheur.e, d’une assistante ingénieure et d’une doctorante, et travaillera sous la supervision scientifique du Dr Pauline Maisonnasse, responsable du projet.

Le projet FluOrganoVax vise à reproduire ex vivo les réponses immunitaires induites dans le nœud lymphatique porcin après vaccination afin de disposer d'un modèle prédictif permettant d'évaluer des formulations vaccinales sans recours systématique à l'expérimentation animale. Ce projet est construit en collaboration avec l’équipe de Lisa Chakrabarti et la plateforme d’Organes-sur-Puces de Samy Gobaa (Institut Pasteur), ainsi qu’avec CEVA Santé Animale. L’ingénieur.e de recherche travaillera en collaboration étroite avec un.e chercheur.e post-doctorant.e basé.e à l’Institut Pasteur qui développera un modèle d’organe-sur-puce à partir des mêmes cellules. Les deux approches seront développées en parallèle et comparées afin de construire une plateforme d'évaluation vaccinale innovante.

Ce poste offre l'opportunité de participer à un projet collaboratif ambitieux à l'interface entre immunologie, virologie, technologies d'organes-sur-puce et développement vaccinal, au sein d'un réseau associant recherche académique et industrielle.

Il conviendra à une personne souhaitant conduire un projet expérimental de manière autonome tout en travaillant en interaction quotidienne avec les membres de l'équipe.

Vous serez plus particulièrement en charge de : 

• Développer le modèle de nœud lymphatique porcin ex vivo
• Mise au point du modèle
• Optimisation des conditions de culture 
• Standardisation des protocoles 
• Caractériser la composition du modèle et les réponses immunes
• Par cytométrie spectrale et/ou de flux (développement de panels pour cellules myéloïdes et lymphocytes)
• Par microscopie confocale
• Par ELISPOT (à mettre en place au laboratoire)
• Par ELISA (anticorps et cytokines)
• Par des tests de neutralisation virale
• Analyser et présenter les données
• Analyses statistiques 
• Interprétation
• Représentation graphique et rédaction

Analyse et valorisation des résultats

• Participation à la conception expérimentale des études ; 
• Analyse des résultats ; 
• Présentation des résultats en interne et en externe ;
• Participation à la rédaction d'articles scientifiques en tant que co-auteur (voire premier auteur selon implication).

Vie du laboratoire

• Application des règles d'hygiène, de sécurité et de qualité ; 
• Participation à l'organisation collective du laboratoire ;

Possibilité d'encadrer des étudiants de Master selon l'avancement 

Merci de transmettre une lettre de motivation et un CV

Formation recommandée :

• Bac +5 à +8 en biologie, biotechnologies, immunologie, microbiologie, virologie ou discipline apparentée ; 
• Diplôme souhaité : Master/Ingénieur ou Doctorat

Compétences indispensables

• Expérience pratique en culture cellulaire ; 
• Expérience des techniques ELISA ; 
• Expérience significative en cytométrie de flux (la cytométrie spectrale serait un atout) ;
• Connaissances en Immunologie et virologie
• Capacité à présenter des résultats en français et en anglais ;
• Bonne connaissance des règles de travail en laboratoire de confinement biologique. 

Compétences appréciées

• ELISpot  
• Tests de neutralisation virale
• Immunologie porcine 
• Maîtrise de logiciels d’analyse (R, FlowJo ou équivalent)

Aptitudes recherchées : 

• Autonomie et esprit d’initiative ; 
• Esprit d'équipe et bonnes qualités relationnelles ;
• Goût pour le développement méthodologique ; 
• Capacité à résoudre des problèmes expérimentaux ; 
• Rigueur ; 
• Intérêt pour les interactions entre immunologie et virologie.

Autres

• Permis B apprécié.