L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Vous serez accueilli.e au sein de l’équipe FREEMA (Fonctionnement et Restauration des Ecosystèmes Estuariens et Poissons Migrateurs Amphihalins) de l’unité EABX (Ecosystèmes Aquatiques et changements globaux). La mission sera réalisée dans le cadre du projet de recherche DEBBARRAGE, financé par la région Nouvelle-Aquitaine, grâce à son programme scientifique de grande ambition régionale sur les ressources en eau (PSGAR ROSEAU).

DEBBARRAGE s’intéresse à l’impact cumulé des obstacles anthropiques le long des cours d’eau sur le métabolisme et le cycle de vie des espèces de poissons amphihalins (poissons se déplaçant entre le milieu marin et les cours d’eau continentaux). Barrages, écluses, seuils et canalisations, de par les modifications qu’ils apportent au fonctionnement hydraulique des cours d’eau, affectent les dépenses énergétiques des poissons migrateurs, leur survie ainsi que la durée de leur migration.

Le projet compte s’appuyer sur les nombreuses données de télémétrie récoltées ces dernières années par divers programmes de recherche et de suivi de populations naturelles, afin d’estimer l’effet de ces obstacles à l’échelle individuelle de chaque poisson.

Votre mission principale sera de contribuer à la gestion de bases de données en lien avec la migration des poissons dans les cours d’eau et avec leur suivi télémétrique.

Vous serez plus particulièrement en charge de :

• Maintenir une base de données existante sur l’effet des paramètres environnementaux (hydraulique, température, etc.) des cours d’eau sur le cycle de vie des poissons amphihalins (base de données FM⁵).
• L’élaboration d’un plan de gestion des données déjà récoltées ou à venir, respectant les principes FAIR.
• La conception d’une base de données additionnelle à la base de données FM⁵ dédiée à la collecte de données issues de divers suivis de télémétrie sur les poissons migrateurs. 
• La préparation des données de télémétrie en vue de leur réutilisation : harmonisation des jeux de données, documentation des contextes d’acquisition, et formalisation des métadonnées.
• La contribution à l’analyse du mouvement des poissons migrateurs : création d’indicateurs, de variables-réponses et réalisation d’analyses statistiques adaptées pour comprendre les effets des contextes d’acquisition sur l’interprétation des comportements migratoires.
• La participation éventuelle à la rédaction d’articles scientifiques, en vue de valoriser les données et/ou les résultats découlant de leurs analyses.

Formation recommandée : minimum requis, niveau licence ou équivalent avec spécialisation en rapport avec la gestion de base de données, ou avec une forte expérience pratique dans ce domaine.

Connaissances souhaitées : langages informatiques SQL et R, biostatistiques (en particulier : estimation de paramètres, notamment par model averaging ou approches Bayésiennes). 

Intérêt démontré pour l’écologie du mouvement, la télémétrie (technologies, protocoles, acteurs) et/ou l’écologie des poissons.

Autres aptitudes souhaitées : connaissance de l’anglais (niveau technique), familiarité avec l’utilisation de formulaires en lignes (outils ODK), expérience dans la gestion de projet et facilité à interagir avec de nombreux interlocuteurs en lien avec les bases de données.