Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Le projet vise à étudier la progression des lignages et les mécanismes guidant la diversification neuronale au cours du développement du système nerveux humain.
Le projet s’appuiera sur des modèles d’organoïdes développés par notre laboratoire ainsi que sur des tissus embryonnaires, associés à des approches omiques globales et surtout à l’échelle de la cellule unique. L’objectif est d’explorer comment les voies de signalisation contrôlent les réseaux génétiques sous-jacents aux décisions de destin cellulaire et à l’évolution de la diversité neuronale dans le rhombencéphale et la moelle épinière humains. La personne recrutée sera en charge de réaliser des expériences sur divers modèles organoides et des tissus post mortem humains, réaliser des analyses bioinformatiques, de superviser des étudiants, techniciens et ingénieurs de l'équipe, présenter ses travaux dans la cadre de séminaires et écrire des articles scientifiques.
Activités :
- Réalisation d’expérience de génomique (Chip-seq et ATAC-seq) en particulier de RNA-seq sur cellules uniques. Le projet requerra de tester de nouvelles méthodes de single cell RNA-seq en particulier sur tissus fixés
- Transcriptomique spatiale
- Réaliser des cultures de cellules souches pluripotentes humaines et leur différenciation en organoides, analyse des différenciation par méthode omics, de PCR ou d’histologie
- analyse de tissus post-mortem embryonnaire par méthode omics, de PCR ou d’histologie
- Imagerie confocale et analyse d’image subséquente. Quantification des données.
- programmation/codage pour l’assemblage et analyse, incluant analyses statistiques, de jeux de ses propres données et de jeux de données existants à l’aide d’outils bioinformatiques.
-Integration des resultats computationelles et experimentaux
- Interprétation des résultats
- Veille documentaire de publications pertinentes pour le domaine
- Rédaction de rapports et de publications scientifiques (figures et écritures)
- Présentation des travaux au sein de l’équipe et lors de réunions scientifiques
- participation à la rédaction de demande de financement
Contexte de travail :
- L’Institut Jacques Monod, situé au cœur de Paris, est un centre international de premier plan, doté d’une forte culture collaborative, offrant un environnement scientifique très interactif et un accès à des plateformes technologiques de pointe.
- L' équipe Ribes/Nedelec propose un environnement de recherche stimulant à l’interface du neurodéveloppement, de la biologie cellulaire et de la génomique. Nous utilisons un large éventail de techniques — organoïdes, tissus embryonnaires, approches omiques, imagerie en temps réel — pour explorer les principes de la spécification du destin cellulaire et de la morphogenèse tissulaire. Nous avons récemment intégré de nouveaux locaux entièrement rénovés, incluant des salles de culture dédiées aux organoïdes humains. L’anglais est la langue de travail pour les réu
Voir plus sur le site emploi.cnrs.fr...

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
- Fort intérêt pour la biologie du développement et le neurobiologie
- Une expertise préalable dans la réalisation et l'analyse de données de transcriptome de cellules uniques est absolument indispensables et doit absolument pouvoir être démontrée.
- Une expérience en culture et différenciation de cellules ES murines ou ES/iPSC humaines sera un avantage très important.
- Un excellent dossier scientifique avec publications sera privilégié.
- Capacité à travailler de manière autonome et collaborative, avec un très bon esprit d’équipe
- Bonnes compétences en communication, bonne maîtrise de l’anglais oral et écrit
Contraintes et risques :
Travail en laboratoire L2. Astreintes le week-end et jours fériés possibles.