L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Vous exercerez votre activité au sein du pôle LEGAe de l’UMR Agroécologie à l’INRAE de Dijon. Au sein de ce pôle, dont les recherches portent sur la génétique et l’écophysiologie des légumineuses à graines, vous rejoindrez l’équipe FILEAS, dont les travaux visent à améliorer la qualité des graines de légumineuses pour l’alimentation humaine (teneur et composition en protéines et acides aminés, propriétés organoleptiques), et à stabiliser le rendement et la qualité des graines dans un contexte de changement climatique associé à des carences minérales. Des approches de génétique d’association et de biologie intégrative (données multi-omiques) sont utilisées pour l’identification de gènes candidats, et des ressources/outils sont développés pour la validation fonctionnelle de ces gènes et l’amélioration variétale. 

Votre mission s’intègrera dans le projet PEASTOL (2026-2028), financé par l’institut Carnot Plant2Pro. L’objectif de ce projet est d’améliorer la tolérance du pois aux stress abiotiques en inactivant des répresseurs potentiels des gènes de réponse aux stress grâce à la technologie CRISPR-Cas9. A partir de données multi-omiques obtenues en amont du projet en conditions de carence en soufre et/ou de déficit hydrique chez le pois, des gènes candidats ont été identifiés au sein de réseaux de régulation génique. Ces gènes, codant pour des facteurs de transcription, sont prédits comme régulant un nombre important de gènes activés par les stress étudiés. Le profil d’expression de ces gènes régulateurs laisse penser qu’ils pourraient jouer un rôle de répresseur. La mutation de ces gènes pourrait alors conduire à une activation des réponses de la plante aux stress, et ainsi à une tolérance accrue de la plante vis-à-vis de ces stress. 

Le projet PEASTOL s’effectue en collaboration avec les équipes SAS et Dragon de l’IJPB (INRAE Versailles), qui ont mis au point un protocole d’édition du génome du pois par la technologie CRISPR-Cas9 (Soulard et al., 2025). Ce protocole est à présent maitrisé et utilisé au sein de l’équipe FILEAS.

Votre mission consistera à caractériser la fonction de certains facteurs de transcription agissant comme des répresseurs putatifs des réponses de la plante aux stress abiotiques chez le pois. 

Vous serez plus particulièrement en charge de :

1. L’édition génomique du pois afin de générer des mutants knock-out pour les facteurs de transcription d’intérêt
2. La caractérisation phénotypique des mutants générés en conditions contrôle et sous contraintes abiotiques (stress hydrique et/ou carence en soufre)
3. La validation des gènes cibles des facteurs de transcription candidats (analyse de données DAP-Seq, transcriptomique comparative chez les plantes sauvages et mutantes)

Pour mener à bien votre mission, vous interagirez avec plusieurs chercheur.es et technicien.nes de l’équipe FILEAS. Vous serez également amené.e à interagir avec les scientifiques de l’IJPB à l’INRAE de Versailles impliqués dans le projet PEASTOL.

Formation recommandée : Doctorat en biologie végétale ou biologie moléculaire.

Connaissances souhaitées : Biologie moléculaire, physiologie moléculaire, biologie végétale, génomique fonctionnelle, physiologie de la nutrition des plantes.

Expérience appréciée : Edition des génomes, transgénèse, culture in vitro, analyses de séquences, transcriptomique (RNA-Seq, RT-qPCR), techniques de clonage (GoldenBraid, Gateway), culture de plantes en conditions contrôlées ou semi-contrôlées, phénotypage.

Aptitudes recherchées : Rigueur, autonomie, organisation, travail en équipe, communication, gestion de projet, encadrement (co-supervision d’étudiant.es), excellentes capacités rédactionnelles, aisance à présenter des résultats en réunion d’équipe et lors de conférences.