Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Résumé du projet scientifique :
Le projet de chaire se situe à l'interface de la biologie structurale, de la bioinformatique et de l'intelligence artificielle (IA), appliquées aux sciences du vivant et de la santé. Il vise à développer des approches innovantes utilisant l'IA pour concevoir des protéines de synthèse capables de mimer ou de créer des réactions enzymatiques et d’interagir avec des partenaires protéiques, modulant leurs modes d’action physiopathologiques. Ces protéines seront également utilisées pour le criblage de molécules organiques, in silico, in vitro ou in cristallo. Le projet s’inscrit dans les thématiques de la virologie et de la glycobiologie, en tirant parti des équipements et expertises du laboratoire et de ses plateformes (PBSIM, CAZy, MaSC). Il inclut des défis allant de la conception de nouvelles protéines à la validation de leurs fonctionnalités, en intégrant des collaborations interdisciplinaires.
Résumé du projet d'enseignement :
Il sera intégré à l’Université Européenne CIVIS, aux Masters de Biologie Structurale et Bio-informatique, et aux formations doctorales du projet France 2030 TIGER, repose sur deux axes : 1) Calcul en IA appliqué à la biologie : les étudiants acquerront les bases de l’IA et son utilisation pour la prédiction des structures protéiques et la conception de protéines de novo, avec des applications en interprétation de structures, modélisation de complexes et développement de médicaments. Et 2) Applications de l'IA en biologie et biomédecine : une présentation des avancées de l'IA au-delà du repliement des protéines, avec un accent sur la découverte de médicaments par criblage IA. L'objectif est de préparer les étudiants aux perspectives futures de l'IA et à leur insertion professionnelle
Le programme intégrera la politique internationale du site via A*MIDEX, le programme doctoral Plinus Cursus, Erasmus+, et bénéficiera des réseaux du laboratoire AFMB ainsi que du soutien du programme H2020
Stratégie de l'établissement :
L’émergence des approches numériques et des technologies d’intelligence artificielle, dans lesquelles le CNRS se positionne de façon très active, accélère considérablement les découvertes scientifiques. Elles constituent une source majeure de progrès en particulier dans le domaine de la biologie structurale pour la recherche de nouvelles configurations moléculaires, la compréhension au niveau atomique des mécanismes du vivant et le développement de stratégies thérapeutiques, diagnostiques ou biotechnologiques.
Dans ce contexte, la chaire de professeur junior vise à la fois à implémenter des approches d’IA pour le développement de la biologie structurale intégrative et à renforcer un de nos laboratoire d’excellence dans le domaine, l’AFMB, largement ouvert sur la communauté nationale et internationale.
Cette chaire s’intègre dans deux des six grands défis sociétaux avec l’intelligence artificielle et la santé et l’environnement en menant des recherches à l’interface des sciences biologiques et numériques.

Stragtégie du Laboratoire :
L'unité AFMB à Marseille est un centre de recherche de premier plan en biologie structurale, reconnue pour son expertise en cristallographie aux rayons X, cryo-microscopie électronique, et approches multidisciplinaires (biochimie, biophysique). Elle bénéficie d’un réseau solide, notamment au sein de FRISBI (French Infrastructure for Integrated Structural Biology), et de technologies de pointe pour des applications médicales et environnementales (mécanismes physiopathologiques, thérapies, biotechnologies). La chaire vise à intégrer l'intelligence artificielle pour élucider les relations structure-fonction des macromolécules, prédire les structures à partir des séquences protéiques et concevoir de nouveaux outils thérapeutiques et biotechnologiques. Ce projet, alliant expérimentation et numérique, renforcera la formation des étudiants en Master et Doctorat et contribuera aux priorités thématiques sur le vivant.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Diffusion Scientifique :
La diffusion des résultats passera par des avancées scientifiques de niveau mondial, qui peuvent se caractériser par des productions de tout type : publications, logiciels, brevets, livres… Par ailleurs, le projet mettra en œuvre une communication vers des cibles diverses telles que communautés scientifiques, médias, décideurs, grand public, scolaires, etc., avec un calendrier adapté. Des outils spécifiques pourront être développés comme des sites web, des newsletters ou encore des rencontres, colloques internationaux, écoles d’été et conférences.
Science Ouverte :
Le CNRS développe une politique forte en faveur de la science ouverte. La science ouverte consiste à rendre « accessibles autant que possible et fermés autant que nécessaire » les résultats de la recherche. À ce titre, le CNRS vise à ce que 100 % des textes des publications issues des travaux de ses unités soient rendues accessibles à tous, notamment grâce au dépôt dans HAL. Les données produites doivent aussi être rendues disponibles et réutilisables, sauf restriction particulière. Par ailleurs, les principes directeurs de l’évaluation individuelle sont revus en conformité avec la déclaration DORA, plus qualitatifs et tenant compte de toutes les facettes du métier de chercheur.
Science et société :
La relation science-société est désormais reconnue comme une dimension à part entière de l'activité scientifique. Le projet développera cette dimension en synergie avec tous les partenaires. Les travaux de recherche qui en seront issus contribueront à éclairer la décision publique. Des initiatives de sciences participatives pourront être initiées avec des acteurs de l’écosystème socio-économique et culturel du projet.
Stragtégie du Laboratoire :
L'unité AFMB à Marseille est un centre de recherche de premier plan en biologie structurale, reconnue pour son expertise en cristallographie aux rayons X, cryo-microscopie électronique, et approches multidisciplinaires (biochimie, biophysique). Elle bénéficie d’un réseau solide, notamment au sein de FRISBI (French Infrastructure for Integrated Structural Biology), et de technologies de pointe pour des applications médicales et environnementales (mécanismes physiopathologiques, thérapies, biotechnologies). La chaire vise à intégrer l'intelligence artificielle pour élucider les relations structure-fonction des macromolécules, prédire les structures à partir des séquences protéiques et concevoir de nouveaux outils thérapeutiques et biotechnologiques. Ce projet, alliant expérimentation et numérique, renforcera la formation des étudiants en Master et Doctorat et contribuera aux priorités thématiques sur le vivant.