Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Nous cherchons à embaucher un·e ingénieur·e de recherche pour travailler au développement et à la maintenance d'outils logiciels destinés au projet de bourse ERC MORPHOFBD, à l'Institut de Biologie de l'École Normale Supérieure (Paris, France). Le ou la candidat·e retenu·e travaillera directement avec Joëlle Barido-Sottani et avec les autres chercheurs employés par le projet MORPHOFBD. L’objectif global de la bourse est de développer et d'implémenter de nouvelles méthodes pour étudier l’évolution passée à partir des informations issues des fossiles. MORPHOFBD se concentrera sur l’inférence phylogénétique bayésienne, une classe de méthodes statistiques utilisées pour reconstituer l’Arbre de la Vie. La majorité du travail de développement sera réalisée au sein du logiciel d'inférence BEAST2 (https://www.beast2.org/), qui utilise le langage de programmation Java et des fichiers de configuration XML. BEAST2 est un projet collaboratif réunissant plus de 20 développeurs répartis entre différentes équipes en France, en Suisse et en Nouvelle-Zélande.
Activités :
La mission principale est d'aider l’équipe de recherche dans l’ensemble des tâches de développement liées au projet, notamment la conception de nouvelles implémentations, la programmation et les tests, ainsi que la maintenance et la correction des bugs. L’ingénieur·e sera également amené·e à proposer des améliorations des implémentations existantes afin d’optimiser les performances ou l’expérience utilisateur. Toutes les tâches de développement suivront de bonnes pratiques de programmation, notamment l’utilisation de git/github, ainsi qu’une documentation et des tests appropriés.
Contexte de travail :
Ce contrat est d’une durée de 2 ans, renouvelable pour 2 années supplémentaires. Le projet se déroulera au sein de l’équipe d’Hélène Morlon à l’Institut de Biologie de l’École Normale Supérieure (https://www.ibens.bio.ens.psl.eu/). L’IBENS est un centre de recherche multidisciplinaire en biologie, rassemblant plus de 300 personnes et idéalement situé dans le Quartier Latin, en plein coeur de Paris. Le centre mène des recherches dans de nombreux domaines, notamment la biologie évolutive, l’écologie, la biologie computationnelle, la génétique et la génomique comparative.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Nous recherchons un·e candidat·e avec une expérience avérée en programmation et en ingénierie logicielle, capable de travailler dans un environnement interdisciplinaire avec des non-programmeurs. Une expérience préalable avec des logiciels de recherche, des méthodes statistiques ou le langage de programmation Java sera appréciée. De bonnes compétences en communication en anglais (niveau B2 minimum) sont requises. Une connaissance de la biologie évolutive serait un atout, mais n’est pas obligatoire.
Contraintes et risques :
Pas de risque particulier, des déplacements courts en France et en Europe peuvent être envisagés selon les besoins.