Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Sujet de thèse :
La principale cause génétique des tumeurs atypiques tératoïdes/rhabdoïdes est la mutation du gène Smarcb1. Pourtant, l'inactivation de ce gène dans de nombreuses lignées cellulaires entrave la prolifération cellulaire et fait l'objet d'une forte contre-sélection. De plus, nous avons montré qu'un contexte développemental spécifique est nécessaire pour que SMARCB1 favorise la prolifération cellulaire. Cela soulève la question de savoir quels facteurs contrôlent l'issue cellulaire de l'inactivation de SMARCB1.Pour répondre à cette question, nous proposons de créer divers modèles d'inactivation aiguë de Smarcb1 (CRISPRi et degron) et de réaliser des criblages génétiques afin d'identifier les gènes dont l'expression altérée permet aux cellules de survivre à la délétion de SMARCB1. Nous étudierons ensuite comment ces gènes sont régulés au cours du développement, en particulier au stade où l'on pense que l'ATRT apparaît. Nous manipulerons leur expression dans des lignées cellulaires ATRT et des modèles PDX afin de déterminer leur contribution à la tumorigenèse. Enfin, nous utiliserons notre modèle de dégradation aiguë de SMARCB1 pour identifier ses gènes cibles directs et précoces (CUT&RUN, TT-seq, HiChIP, protéome) et approfondir l'étude de son mécanisme d'action.
Contexte :
Le/la doctorant(e) sera accueilli.e au sein de l'UMR3215 sur le campus de l'institut Curie (Paris 05) et travaillera sous la direction de R. Margueron. L'étudiant sera affilié à l'école doctorale complexité du vivant (CDV515). Ce recrutement s’inscrit dans le cadre du PEPR Cell-ID.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Contraintes et risques :
Travail en milieu confiné.