Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Les tapis microbiens sont des écosystèmes complexes caractérisés par des forts gradients redox. Au sein de ces communautés très diverses s’établissent souvent des symbioses métaboliques ou syntrophies pour exploiter des niches écologiques spécifiques. C’est le cas des consortia symbiotiques d’archées Asgard, avec d’autres partenaires procaryotes. Ce projet vise à analyser des génomes appartenant à des lignées méconnues assemblés à partir de métagénomes de tapis microbiens et d’autres environnements à transition redox pour prédire leur potentiel fonctionnel et comprendre leur rôle écologique et leur importance évolutive.
Activités :
Analyse bioinformatique de séquences massives
Assemblage de métagénomes et de MAGs (metagenome-assembled genomes)
Annotation de gènes et inférence métabolique
Analyse phylogénétique et phylogénomique
Contexte de travail :
Cette offre est financée par le projet ERC AdG SYMBEK. La personne recrutée intègrera l’équipe DEEM –Diversité Ecologie et Evolution Microbiennes (http://www.deemteam.fr/en/). Notre laboratoire est situé dans le nouveau campus de l’Université Paris-Saclay, environ 30 km au sud de Paris. Un train de banlieue connecte avec Paris.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Le candidat (H/F) doit avoir une ample connaissance en diversité, métabolisme et écologie des microorganismes ainsi que de l’expertise en analyse approfondi de métagénomes, génomique comparative et phylogénie moléculaire. Le candidat (H/F) devra être fluide en langue anglaise (écrite, parlée), avoir des bonnes capacités de présentation et communication, autonomie, organisation et esprit critique.
Contraintes et risques :
Le postdoc comporte un travail bioinformatique, sans risque particulier. Le travail sera réalisé sous les règles de sécurité normative.