Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Le post-doctorant contribuera à l'étude des communautés microbiennes de Saccharomyces. Cela comprend l'analyse génomique des populations, la reconstruction des communautés microbiennes et l'étude de leurs interactions. Le post-doctorant collaborera également à d'autres projets en cours dans le groupe (https://ircan.org/en/research/gianni-liti).
Activités :
Activités
Le post-doctorant effectuera des expériences et des analyses informatiques pour caractériser les communautés microbiennes de Saccharomyces :

Principales tâches :
- Séquençage du métagénome et analyse bioinformatique
- Isolement et caractérisation des espèces microbiennes
- Étude des interactions microbiennes par phénotypage et transcriptomique
- Étude des flux de gènes entre les communautés microbiennes par génomique et phénotypage.
Contexte de travail :
Le post-doctorant sera affecté à l'équipe du Dr Gianni LITI « Génomique des populations et traits complexes ». L'équipe est l'une des équipes fondatrices de l'IRCAN et est située à la Faculté de Médecine de Nice. L'équipe dispose de tout l'équipement nécessaire pour les expériences de génétique et de génomique de la levure et a accès à des équipements de pointe en microscopie, cytométrie et génomique, ainsi qu'à des serveurs de calcul et de stockage.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Une expérience préalable en génétique et génomique de la levure est essentielle
Une connaissance avancée de l'analyse bioinformatique par séquençage de nouvelle génération est essentielle ainsi qu'un solide bagage statistique
Des compétences expérimentales et informatiques en métagénomique sont souhaitées.
Contraintes et risques :
Le système avec lequel nous travaillons (la levure) est connu pour être sûr et non pathogène. Certains des produits chimiques utilisés dans les expériences sont toxiques et doivent être manipulés conformément aux instructions. Une initiation à la sécurité sera donnée avant le début des activités expérimentales.