Le Laboratoire d’Hydrologie de Nancy (LHN) intervient en particulier pour le compte de la direction générale de la santé (DGS) en tant que laboratoire national de référence sur les eaux. Parallèlement à ces missions, le laboratoire mène des activités de recherches dans le domaine de la chimie et de la microbiologie des eaux.

L’unité de microbiologie des eaux réunit 10 personnes qui travaillent sur des pathogènes bactériens, parasitaires, viraux ou fongiques. Les thématiques abordées, portent sur le développement de méthodologies adaptées à la recherche de ces pathogènes dans les eaux et des matrices environnementales associées (sédiment, boues de station d’épuration) ; la conduite de campagnes visant à mesurer la présence de ces micro-organismes dans divers milieux hydriques environnementaux; l’étude du comportement (survie, adhésion agrégation…) de ces pathogènes dans les milieux hydriques. L’acquisition de connaissances dans ces différents domaines contribue à mettre en place des modèles d’analyses quantitatives de risques destinés aux gestionnaires du risque. Les méthodologies développées permettent en outre de réaliser des missions d’investigations dans le cadre de Toxi Infections Alimentaires Collectives d’origines hydriques. L’unité gère également la plateforme de spectrométrie de masse MALDI-TOF de l’agence pour l’identification et la caractérisation d’isolats bactériens.

Sous l’autorité du responsable de l’unité de microbiologie des eaux, vous serez chargé de réaliser des analyses de détection/quantification de micro-organismes pathogènes de classe 2 dans les échantillons environnementaux notamment par le biais de méthodes de détection de biologie moléculaire et de culture cellulaire. Il sera également en charge de la caractérisation de séquences génomiques. Il participera à la préparation d’échantillons en vue de les envoyer à des laboratoires partenaires pour analyses complémentaires.

A ce titre, dans un contexte exigeant en terme de dispositions qualités et de biosécurité, vous devrez :

Analyser des échantillons environnementaux pour détecter/quantifier des bactéries, des parasites, et des virus par culture et isolement sur des milieux adaptés ou par des méthodes de biologie moléculaire.

-        Identifier des microorganismes par des techniques de biologie moléculaire type RT-PCRq, ddRT-PCR et de séquençage.

-        Participer à des travaux de recherche.

-        Participer aux campagnes de prélèvements d’échantillons.

-        Participer à l’organisation des envois d’échantillons vers les laboratoires partenaires notamment dans le cadre d’essais inter-laboratoires.

-        Assurer la gestion des matériels, des produits, des consommables et des installations.

-        Effectuer de la veille scientifique et technique dans son domaine.

-        Contribuer à l’élaboration des documents du système qualité et au dispositif de biosécurité en place au laboratoire.

Manipulation d'agents pathogènes de classe 2 en laboratoire de biosécurité de niveau 2 (BSL2).

Port d'équipements de protection individuelle (EPI).

Déplacements possibles sur le terrain

§  Formation et expérience requises :

-        BAC minimum.

-        BAC +3 souhaité en microbiologie

-        Expérience au sein d’un laboratoire académique ou d’analyses dans le domaine de la microbiologie environnementale (hydrologie, …) ou alimentaire est nécessaire

 §  Compétences :

-        Compétence en culture cellulaire appréciée

-        Culture et isolement de micro-organismes bactériens, parasites et viraux sur milieux sélectifs ou non

-        Caractérisation de micro-organismes par des techniques de biologie moléculaire.

-        Maitrise des techniques de biologie moléculaire (Extraction génomique, PCR, séquençage...)

-        Gestion de bases de données et connaissance des outils statistiques; connaissance d’outils en bio-informatiques pour le retraitement des résultats

-        Aptitude au travail en équipe, capacité d’organisation et de rigueur. Esprit d’initiative.

-        Mobilité ponctuelle indispensable pour répondre à des demandes particulières.

-        Respect des dispositions réglementaires, normatives et du système qualité du laboratoire.

-        Connaissance du domaine de la biosécurité et biosûreté (exposition à des risques chimiques et biologiques)

Adresser au plus tard le 10/07/2023, lettre de motivation + CV en indiquant la référence 2023-124 à recrutement@anses.fr