Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :

Le/la postdoctorant(e) étudiera de façon fine l'hétéro-agrégation des microplastiques avec des micro-organismes dans des écoulements, en quantifiant l'effet des microplastiques et des conditions hydrodynamiques sur le développement des biofilms et sur la structure des agrégats formés. Ce travail s'appuiera sur une plateforme microfluidique et acousto-fluidique en cours de développement au laboratoire, permettant la culture, l'observation et la manipulation des objets. Une attention particulière sera portée à la composition biologique et propriétés des biofilms.

Activités :

• Mise en place et optimisation des protocoles expérimentaux : culture de micro-organismes (bactéries, micro-algues) en écoulement microfluidique, préparation et caractérisation de suspensions de microplastiques modèles

• Réalisation des expériences d'hétéro-agrégation et suivi de la formation des biofilms par microscopie optique et fluorescence

• Analyse et quantification de la structure et de la croissance des biofilms (imagerie, analyse d'images)

• Analyse de l'expression de gènes d'intérêt (RT-qPCR) en fonction des conditions de culture (écoulement, présence et propriétés des microplastiques)

• Analyse des données, rédaction d'articles scientifiques, présentation des résultats en conférences

• Participation à l'encadrement et à la vie scientifique du laboratoire

Contexte de travail :

Le/la postdoctorant(e) sera accueilli(e) au laboratoire PMMH (Physique et Mécanique des Milieux Hétérogènes, UMR 7636 CNRS–ESPCI–PSL–Sorbonne Université–Université Paris Cité), à Paris (5e arrondissement), au sein de l'équipe d'Alice Pelosse. Le projet se situe à l'interface entre la mécanique des fluides, la physique de la matière molle et la microbiologie environnementale. Il sera mené en collaboration étroite avec l'équipe d'Olivier Espeli au Centre interdisciplinaire de recherche en biologie, Collège de France, pour tous les aspects de microbiologie (biofilms, génétique bactérienne).

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :

• Solide background en microbiologie, écologie microbienne et études de biofilms : culture de bactéries et/ou de micro-algues, techniques de caractérisation classiques (suivi de croissance, microscopie optique et confocale, marquages fluorescents) et

• analyses biomoléculaires (extraction d'ADN, PCR, qPCR, analyse de séquençage)

• Connaissance des microplastiques et de leurs interactions avec les micro-organismes, maîtrise des techniques avancées de caractérisation des polymères

• Maîtrise de l'analyse d'images et des outils de traitement de données (Python)

• Rigueur expérimentale, autonomie et capacité à travailler dans un environnement interdisciplinaire à l'interface physique–biologie

• Bonnes compétences en communication scientifique (anglais courant, rédaction scientifique)

Contraintes et risques :