Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
L’ingénieur logiciel sera chargé du développement de logiciels pour l’analyse d’images de cryo microscopie électronique (cryo-EM), intégrant des simulations de dynamique moléculaire, pour la recherche académique et industrielle en biologie structurale et en découverte de médicaments. L’objectif principal est d’améliorer les performances d’un logiciel existant, tant en termes de vitesse de calcul et de robustesse, que d’autonomie fonctionnelle, d’ergonomie de l’interface utilisateur et de facilité de maintenance. Les responsabilités englobent l’analyse des besoins, la conception architecturale et fonctionnelle, le développement, les phases de test, l’intégration et le déploiement. Ce poste nécessite une expérience préalable en développement logiciel appliqué à l’analyse d’images de cryo-EM de complexes biomoléculaires (analyse de particules isolées). Une expérience préalable en développement logiciel pour l’étude de la dynamique moléculaire en cryo-EM ou en simulation moléculaire serait un atout.
Activités :
Concevoir et piloter des développements logiciels :
- Analyser les besoins, planifier les tâches et gérer les risques
- Définir et structurer des architectures logicielles
- Gérer la mise en production

Développer des solutions logicielles performantes et riches en fonctionnalités :
- Analyser l’architecture et le code existants, et implémenter des améliorations adaptées
- Ajouter de nouveaux modules et fonctionnalités aux logiciels existants
- Assurer l’évolution et la maintenance des logiciels

Apporter un support aux utilisateurs :
- Concevoir des guides d’utilisation et des tutoriels
- Former les nouveaux utilisateurs (formations en ligne ou en présentiel)
- Garantir la fiabilité des logiciels

Contribuer à l’amélioration continue :
- Optimiser les outils et les processus de développement
- Administrer les dépôts de code
- Assurer une veille technologique pour rester à la pointe de l’innovation

Contexte de travail :
L'Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC-UMR 7590, Sorbonne Université, 75005 Paris) est une unité mixte de recherche affiliée au CNRS, à Sorbonne Université et au Muséum National d'Histoire Naturelle, regroupant environ 200 membres. L’IMPMC est un laboratoire pluridisciplinaire, composé de chercheurs, enseignants-chercheurs et ingénieurs issus des disciplines différentes (physique, science de la Terre, biologie, chimie, informatique, etc.). Des thèmes de recherche expérimentale et théorique divers y sont traités tel que l'élucidation de la structure des matériaux et des assemblages macromoléculaires, investigation de leurs propriétés dynamiques, étude des interactions entre le vivant et le minéral, etc.

La personne recrutée intégrera l’IMPMC dans le cadre d’un projet de recherche financé par l’Agence Nationale de la Recherche française (ANR). Il/elle rejoindra une équipe dynamique, engagée dans une démarche continue de dév
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
- Doctorat en physique ou en informatique

Compétences techniques :

- Connaissances avancées en physique et en mathématiques pour comprendre l'analyse d'images informée par la physique et la géométrie
- Bases théoriques solides en traitement d'images, apprentissage automatique et statistiques
- Expérience préalable (obligatoire) en développement logiciel appliqué à l’analyse d’images de cryo-EM de complexes biomoléculaires (analyse de particules isolées)
- Expérience préalable en développement logiciel pour l’étude de la dynamique moléculaire en cryo-EM ou en simulation moléculaire serait un atout
- Maîtrise des langages de programmation Python, C/C++ et Fortran
- Maîtrise des techniques de parallélisation des codes CPU et GPU
- Maîtrise du cycle de vie d'un logiciel et des bonnes pratiques en matière de qualité logicielle
- Maîtrise des systèmes Linux et de la ligne de commande
- Maîtrise des outils de gestion de version logicielle (e.g., Git)
- Maîtrise des outils de conteneurisation (e.g., Docker)
- Excellente communication orale et écrite en anglais

Compétences générales :

- Curiosité intellectuelle et l’esprit analytique
- Fort intérêt pour la recherche interdisciplinaire à l'interface de l'informatique, de la physique et de la biologie, et pour le développement logiciel afin de relever les défis biomédicaux
- Sens de l'organisation, autonomie et efficacité
- Engagement pour la qualité et la rigueur du travail
- Capacité à rendre compte de manière efficace par écrit et oralement
- Prise d'initiative
- Capacité à développer une vision stratégique
- Bon relationnel et esprit d’équipe

Contraintes et risques :