Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
La mission consiste en l’analyse de données de type « omics » (Hi-C, ChIP-Seq, MNase-Seq, etc) et en l’assistance des membres de l’équipe pour la réalisation de leurs propres analyses.
Activités :
. Analyse et visualisation de données « omics »
. Refactorisation et développement de pipelines pour les analyses de ChIP-seq et de MNase-seq
. Rédiger des fiches guides pour la réalisation autonome d’analyses de données omics
. Rédaction de fiches de travail à destination des membres de l’équipe pour la réalisation autonome de leurs analyses de données omics

Contexte de travail :
Localisé à l'ENS de Lyon, dans un environnement multidisciplinaire riche, le LBMC est un laboratoire de biologie expérimentale dont l'objet d'étude est la cellule, l'unité fondamentale du vivant.

Les 15 équipes du LBMC intègrent dans leurs recherches différents aspects de la vie cellulaire comme la prolifération, la différentiation et l'interaction avec l'environnement cellulaire dans un contexte normal ou pathologique. La recherche fondamentale menée au laboratoire s'appuie sur une expertise en biologie cellulaire et moléculaire et est résolument tournée vers l'interdisciplinarité intégrant des approches en (bio)informatique, (bio)physique et (bio)mathématique.

L’équipe « Chromatin Dynamics in Mitotic Chromosome Assembly » s’intéresse au processus d’assemblage des chromosomes mitotiques par le complexe Condensine, et son intersection avec la dynamique structurale de la chromatine. L’équipe mobilise des approches de génomique à haut-débit dans l’organisme modèle S.pombe.

Les avantages attachés à cette collaboration :
• Un environnement de travail interdisciplinaire stimulant aux contacts des personnels de la recherche
• Un accompagnement professionnel avec des formations.
• Un restaurant d'entreprise qui permet de bien déjeuner à un prix intéressant.
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%) ou forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Un site accessible en transport en commun (Métro + Trams + bus) et vélo

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Savoir-faire
. Expertise en programmation, notamment à usage des biologistes (Python et/ou R)
. Expertise dans l’analyse de données biologiques de type « omics »
. Expertise dans le développement bioinformatique (packages)

Savoir-être
. Capacité à travailler en équipe et répondre aux besoins de ses collègues
. Capacité gérer plusieurs projets distincts en parallèle

Transverses
. Capacité à se former sur de nouvelles technologies/langages
. Veille technologique dans son domaine d’expertise
. Transfert de compétences aux membres non-bioinfo de l’équipe
Contraintes et risques :
R.A.S.