Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Dans le cadre de ce poste, il s'agira de contribuer au développement d'un nouveau dispositif de microscopie optique super-résolu) pour des applications biologiques. En particulier, dans le cadre du projet, il s'agira de mettre en place une détection originale, basée sur la mise en place de dispositif de reimagerie oblique type OPM (Oblique Plane Microscopy). Ce travail s'incrit dans un cadre étant interdisciplinaire (optique, électronique, traitement d'images (deep learning), traitement du signal, informatique, chimie, biologie), la personne recrutée sera plus particuliérement en charge de la partie optique tout en travaillant en synergie avec le reste de l'équipe sur les autres domaines.
Activités :
La personne contribuera dans le cadre du projet à :
- développer une nouvelle implémentation de la détection du microscope super-résolu via un dispositif de reimagerie utilisant un objectif de type snouty
- contribuer au développement d'outils de traitement de données/images, pouvant mobiliser des approches de deep learning
- de contribuer à la programmation de l’expérience et à la réalisation d'outils de simulation
- de tester sur différentes applications biologiques, notamment sur des objets complexes tels que des organoïdes
- de développer de nouvelles approches de calibration et de marquage des échantillons par DNA-PAINT
- de rédiger des rapports d'avancement et des articles
- de participer à des conférences nationales et internationales
Contexte de travail :
Ce travail se fera au sein de l'équipe Nanobio de l'ISMO (Unité Mixte CNRS / Université Paris-Saclay) dans le cadre de différents projets européens en collaboration avec des équipes européennes et l' entreprise Abbelight. L'équipe Nanobio développe de nouvelles modalités de microscopie de fluorescence permettant de repousser les limites de ces observations aussi bien en termes de vitesse d'acquisition que de profondeur d'observation pour des applications allant de la biologie à l'étude de nanomatériaux. Ces développements sont au croisement de différentes disciplines et mettent en jeu des compétences allant de l'optique, l'électronique, le traitement des images/data, la chimie et la biologie, et s'adresse donc en particulier à des candidats souhaitant travailler au cœur de cette interdisciplinarité avec une formation dans l'un de ces items majeurs, et souhaitant découvrir les items connexes. Le laboratoire dispose de différents microscopes pour la localisation de molécule unique, ainsi que l'accès à différents équipements communs (laboratoire de culture cellulaire L1/L2, atelier mécanique/électronique) pour mener à bien l'ensemble du projet.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Des compétences techniques sont attendues dans le domaine de l'optique/physique, ainsi qu'idéalement des connaissances dans la programmation en python.
La personne recrutée aura idéalement une expérience précédente dans le développement ou l'utilisation d'un microscope de fluorescence appliquée à des problématiques biologiques.
La personne recrutée devra pouvoir partager régulièrement sur son travail et montrer un intérêt pour le travail en équipe et l'interdisciplinarité.
Contraintes et risques :
- faisceau laser
- culture cellulaire