Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
La personne recrutée participera à la mise en place et à la réalisation d'une étude à l'échelle du génome (genome-wide) visant à analyser la stabilité des ARNs (RNA decay assay) chez l'organisme modèle Caenorhabditis elegans. Ce projet s'inscrit dans le cadre du projet ANR JCJC intitulé « Epigenetic State-RNA
Activités :
Placé(e) sous la supervision directe de la responsable de l'équipe, le/la contractuel(le) participera à la mise au point de l'approche expérimentale s'appuyant sur deux protocoles. Il/elle effectuera un premier réplicat en binôme avec sa responsable (phase de formation), puis réalisera les 3 réplicats biologiques suivants en autonomie afin de produire les échantillons destinés au séquençage.
Activités principales :
- Recherche et analyse bibliographique pour s'approprier le contexte scientifique et les questions biologiques du projet.
- Participation aux réflexions méthodologiques sur le protocole expérimental et aux discussions avec les plateformes de bioinformatique et de séquençage (définition des contrôles nécessaires aux analyses ultérieures).
- Culture, maintenance et synchronisation des organismes modèles (préparation et coulage des boîtes de culture).
- Réalisation des essais de stabilité des ARNs (RNA decay assay) nécessitant la manipulation d'un bloqueur de la transcription (alpha-amanitine).
- Extractions d'ARN total, dosages précis, calculs de dilutions et application des bonnes pratiques de laboratoire (pipetage de précision, règles de sécurité).
- Contrôle qualité et validations par RT-qPCR, puis analyse des données de RT-qPCR.
- Tenue à jour quotidienne et détaillée du cahier de laboratoire électronique.
- Gestion ponctuelle du matériel et des réactifs liés au projet (référencement, commandes simples si nécessaire).
- Rédaction d'un rapport de fin de mission synthétisant l'ensemble des protocoles et résultats (rédigé de préférence en anglais).

Activités secondaires :
- Participation aux réunions d'équipe (lab meetings).
- Contribution aux tâches collectives et à la vie du laboratoire.

Contexte de travail :
Le poste est situé au sein de l'équipe Mattout / DiStefano (UMR 5077 CNRS / Université Toulouse III - Paul Sabatier).
L'activité se déroulera au Centre de Biologie Intégrative (CBI, Toulouse), un pôle de recherche regroupant près de 400 personnes sur le campus de l'Université Paul Sabatier (https://cbi-toulouse.fr/).

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Compétences techniques requises :
- Expérience pratique indispensable en biologie moléculaire : extractions d'ARN, RT-qPCR, dosages d'acides nucléiques, calculs de concentrations/dilutions.
- Expérience préalable de travail avec un organisme modèle obligatoire (une expérience spécifique sur C. elegans est un plus, mais non obligatoire).
-Maîtrise des techniques de base de laboratoire (pipetage, calcul mental appliqué aux préparations de solutions, règles d'hygiène et sécurité).
- Des notions de base ou un intérêt pour la bioinformatique constitueront un plus pour la compréhension globale du projet.
- Anglais scientifique fonctionnel (lecture d'articles et de protocoles, suivi des réunions, rédaction du rapport de fin de mission).

Savoir-être :
- Rigueur expérimentale, minutie et précision.
- Flexibilité et capacité d'adaptation (nécessaires pour le travail sur le vivant).
- Fiabilité, sens de l'organisation et capacité d'anticipation.
- Aisance relationnelle et bonne communication pour travailler en interaction directe avec la responsable du projet.

Formation et niveau de recrutement :
Niveau Master 2 (M2) pour un profil Ingénieur d'études (IE) ou Doctorat (PhD) pour un profil Ingénieur de recherche (IR) en biologie moléculaire, génétique ou biologie cellulaire.


Contraintes et risques :
Risque chimique : Manipulation d'un bloqueur de transcription (alpha-amanitine), agent toxique nécessitant le respect des consignes de sécurité (travail sous sorbonne, port des EPI) et la validation de la médecine de prévention du CNRS.
Risque lié aux équipements de travail
Risque lié au travail isolé
Organisme modèle : Manipulation de C. elegans, un ver modèle inoffensif pour la santé humaine (aucun risque biologique).
Travail sur écran : Saisie des données et tenue du cahier de laboratoire.