Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Analyse de données de génomique et transcriptomique environnementale de la flore algale et fongique présente dans la neige fondante.
Activités :
La personne recrutée devra finaliser les analyses de plusieurs jeux de données de métagénomique et de métatranscriptomique d'efflorescence algale des neiges. Les objectifs sont notamment de produire un catalogue des gènes de l'espèce Sanguina nivaloides.
Contexte de travail :
L'ingénieur travaillera dans le cadre du projet de recherche ALPALGA mené en collaboration avec l'équipe de Eric Maréchal au laboratoire Physiologie cellulaire végétale (LPCV) à Grenoble. Il s'intégrera dans l'équipe MEEBIO du Laboratoire d'Ecologie Alpine (LECA) sous la direction d'Eric Coissac.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
– Maitrise des logiciels d'analyse de séquences et du traitement des données de séquences haut débit (lectures courtes et longues).
– Maitrise des outils d'assemblage des métagénomes et métatranscriptomes.
– Maitrise de l'environnement Unix et du logiciel statistique R.
Contraintes et risques :
Il s'agit d'un travail d'analyse de données réalisé sur ordinateur. Toutes les données sont déjà acquises, aucun risque professionnel particulier n'est à signaler.