Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Analyses bioinformatiques des séquences répétées du génome à partir de données de séquençage du génome et de la méthylation de l’ADN au moyen de technologies en lectures courtes (Illumina, BS-seq) et longues (ONT).
Activités :
Travail sous linux. Gestion, analyse, et intégration des données NGS et des espaces de travail de l’équipe sur cluster de calcul. Interaction avec la plateforme. Mise en place de pipelines d’analyse, diffusion (github), et formation des membres de l’équipe à leur utilisation.
Contexte de travail :
Équipe PEpiTE (Polyploidy, Epigenetics, and TEs)

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Compétences en programmation essentielles (Python, Bash, R). Travail sur HPC. Interprétation des données en lien avec les questions biologiques. Travail en équipe. Autonomie. Veille méthodologique.
Contraintes et risques :
Présentiel 4j/5. Travail sur écran