Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Le·la chercheur·e postdoctoral·e travaillera au sein du Laboratoire d’Écologie Microbienne, dans le cadre du projet ADAPT-HC, financé par l’ADEME dans le cadre du programme GESIPOL.
Le projet ADAPT-HC vise à développer une méthodologie innovante pour concevoir et optimiser des stratégies de bioremédiation des eaux souterraines contaminées par des hydrocarbures.
Il·elle travaillera à l’interface entre l’écologie microbienne, la bioinformatique et le génie de l’environnement, en étroite collaboration avec des partenaires industriels (HYDREKA, TAUW France).
Il·elle sera chargé·e d’intégrer des approches de biologie moléculaire, en particulier la métagénomique environnementale, afin de mieux comprendre le rôle des micro-organismes dans la biodégradation des hydrocarbures en conditions aérobies et anaérobies

Activités :
Les principales activités sont :
- Réaliser des analyses de métagénomique environnementale à partir d’expériences de bioremédiation en laboratoire et sur le terrain.
- Déterminer des indicateurs fonctionnels et taxonomiques pertinents à partir des données métagénomiques.
- Étudier les interactions microbiennes au sein des systèmes d’eaux souterraines contaminées.
- Identifier les facteurs environnementaux favorisant la dégradation des hydrocarbures

Contexte de travail :
Le Laboratoire d'Écologie Microbienne (LEM) du CNRS à Lyon est un centre de recherche de renommée mondiale, où la passion pour la science et l'innovation se rencontrent. Notre laboratoire se consacre à l'étude des interactions complexes entre les micro-organismes et leur environnement.
Au LEM, nous explorons les mécanismes fondamentaux des interactions microbiennes, de l'échelle moléculaire à celle de l'écosystème. Nos travaux ont un impact direct sur des problématiques cruciales telles que le changement climatique, la résistance aux antibiotiques, et la bioremédiation des sols et des eaux.

Nous vous proposons :
• Un environnement de travail stimulant aux contacts des personnels de la recherche
• 44 jours de congés / RTT par an
• Des formations adaptées pour vous accompagner
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%) + forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Participation financière au frais de mutuelle

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Nous recherchons un·e candidat·e hautement motivé·e, titulaire d’un doctorat en microbiologie, écologie microbienne, biotechnologies environnementales ou dans une discipline connexe. Les candidat·e·s doivent posséder une solide expérience en biologie moléculaire environnementale et en analyse de données métagénomiques.
Des compétences en bioinformatique (R, Python, analyse de données omiques) sont fortement appréciées.
La capacité à travailler de manière autonome tout en s’impliquant dans une recherche collaborative et interdisciplinaire est essentielle, de même que d’excellentes compétences en communication en anglais

Contraintes et risques :
RAS