L’université de Bordeaux est une grande université dynamique, responsable, attentive au bien-être de ses personnels. La rejoindre, c’est travailler dans un cadre privilégié au sein d’une communauté professionnelle particulièrement diverse et ouverte, en bénéficiant de dispositifs d’accueil et d’inclusion, de formation et de mobilité interne. C’est participer à une aventure académique, scientifique et humaine. C’est s’engager à relever les défis du XXIe siècle.

Le centre Bordeaux Population Health (BPH, U1219 Univ. Bordeaux - Inserm), l’un des principaux centres de recherche en santé des populations en France, comprend 10 équipes (~500 personnes) travaillant sur des thématiques diverses en santé publique, avec 5 domaines transversaux d’excellence: (i) santé cérébrale tout au long de la vie; (ii) science des données (IA, épidémiologie moléculaire, cohortes longitudinales, bases médico-administratives); (iii) maladies infectieuses et santé globale; (iv) vieillissement et résilience; (v) déterminants environnementaux et sociaux de santé.

Ce poste sera soutenu par une prestigieuse bourse ANR-JCJC récemment obtenue par le Dr. Mishra pour le projet "The brain resilience initiative : genes shielding the brain from cerebrovascular insults" (BRICS).

Le candidat bénéficiera d'interactions étroites avec :

- D'autres équipes / partenaires ayant une expertise en biostatistique, épidémiologie, imagerie cérébrale, modèles expérimentaux de maladies cérébrovasculaires, neurologie clinique).

- Collaborateurs internationaux au sein des consortiums CHARGE et International stroke genetics, et des réseaux BRIDGET, SHIVA et MatriSVDs.

Dans ce contexte, nous recherchons un.e Épidémiologiste en génétique.
Vous serez en charge d'identifier les déterminants génétiques de la résistance du cerveau aux lésions cérébrales vasculaires.
Activités principales :
Traitement des données GWAS et WGS (pipeline GATK, plink1.9/2,), analyse d'association (plink2, REGENIE), et méta-analyse (R, METAL etc.). GWAS and WGS data processing (GATK pipeline, plink1.9/2,), association analysis (plink2, REGENIE), and meta-analysis (R, METAL etc.)
Développement de modèles de prédiction du risque en utilisant des approches de régression (R, plink 1.9/2 etc.) ou d'apprentissage automatique (random forrest). Development of risk prediction models using regression (R, plink 1.9/2 etc.) or machine learning (random forrest) approaches
Description du projet/opération :
Les lésions cérébrales vasculaires telles que l'ischémie ou l'hémorragie peuvent déclencher une neurodégénérescence progressive. Cependant, peu d'attention a été accordée à la compréhension du mécanisme de résilience du cerveau à ces lésions vasculaires. Sur la base de deux prémisses établies : (1) le score de risque polygénique quantifie la responsabilité génétique de l'accident vasculaire cérébral en raison d'allèles de risque communs ; et (2) les variantes génétiques rares atténuent les effets des facteurs génétiques causaux des maladies neurodégénératives, le projet BRICS a été proposé pour améliorer nos connaissances sur les fondements génétiques de la résilience du cerveau aux insultes cérébrovasculaires.
 Description précise des résultats attendus :
- Étude d'association pangénomique sur les marqueurs IRM de la maladie des petits vaisseaux cérébraux, de l'accident vasculaire cérébral et de la démence
- Développement d'un modèle de pointe de score de risque polygénique (PRS) d'ischémie et d'hémorragie dans le cerveau.
- Nouvel ensemble de données cas-témoins sur la résilience cérébrale défini en exploitant les informations sur la responsabilité génétique des lésions cérébrales vasculaires et les informations d'imagerie cérébrale dans les cohortes basées sur la population disponibles (3C, MEMENTO, UK biobank, etc.).
- Étude d'association WGS pour cartographier les gènes associés à la résilience du cerveau à l'ischémie et/ou à l'hémorragie cérébrale.
- Identification de gènes candidats pour des études fonctionnelles et in vivo approfondies.
- Rédaction de manuscrits pour publication dans des revues à fort impact.
Modalités d’évaluation et de contrôle du résultat :
- Réunions individuelles régulières avec les mentors.
- Mises à jour du projet lors de la réunion hebdomadaire BrainVasc (avec chercheurs travaillant sur les études d'association pangénomique sur les maladies vasculaires du cerveau), des réunions bihebdomadaires du laboratoire ELEANOR, des réunions virtuelles du groupe de travail CHARGE et de l'ISGC.
- Présentation des résultats lors de conférences internationales (au moins une fois par an).
- Publication de manuscrits

Titulaire d’un diplôme Master 2 dans le domaine de l’épidémiologie, cette fonction requiert :

Compétences en programmation en R et, si possible, dans d'autres langages de programmation, y compris Python.
Capacité à rédiger des documents/procédures et des articles scientifiques.
Esprit d'équipe avec d'excellentes compétences interpersonnelles et d'adaptation.
Maîtrise de l'anglais parlé et écrit

Basé à Bordeaux - accès tram A (arrêt de tram Hôpital Pellegrin) bus, vélo.

Adresse : Centre BPH U1219, Université de Bordeaux, 146 rue Léo Saignat 33076 Bordeaux Cedex

CDD de projet de 24 mois à pourvoir du 01/02/2024 au 30/01/2026

Salaire mensuel brut : 2 460€ bruts mensuels

Avantages liés au poste :

Forfait jours de congés annuels dès la première année (50 jours par an)
Télétravail possible selon nécessités et organisation du service
Prise en charge à 75% de l’abonnement aux transports en commun de Gironde
Participation à la mutuelle à hauteur de 15€ / mois
Des offres loisirs, sport et culture pour tous les personnels 
Forfait "mobilités durables" sur trajet domicile – travail
Parcours d’accueil et formations
Processus de recrutement : après la période de publication de l’annonce, nous prendrons contact avec les candidats retenus pour un entretien organisé avec le(s) manager(s) et le chargé de recrutement.

Conseil : votre lettre de motivation est lue et nous apporte des éléments complémentaires à votre CV !