Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Optimisation et développement du site web CRISPOR.org pour la conception d’expériences d’édition du génome avec le système CRISPR-Cas9 dans le cadre d’une collaboration entre la plateforme TACGENE et le Human genome browser genome.ucsc.edu


Activités :
Optimisation de l’interface du site CRISPOR.org pour la conception d’expériences d’inactivation de gène avec le système CRISPR-Cas9 ; Développement de nouveaux outils pour la conception d’expériences de modification précise de gènes, y compris avec les approches de deuxième génération, éditeurs de base et prime editing ; suivant les compétences, le temps de calcul des alignements de séquences nécessaires pour la recherche de cibles off-targets pourra également être optimisé.
Contexte de travail :
mi-temps ou plein temps suivant les disponibilités, possibilité de télétravail partiel
Rémunération selon la grille CNRS
Moyens mis à disposition:
Ordinateur de bureau, accès réseau, accès centre de calcul MNHN et UCSC
Interlocuteurs:
Jean-Paul Concordet, CRHC Inserm, co-directeur TACGENE, Max Haeussler, director of public platforms, UCSC Genomics Institute

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
biologie moléculaire et bioinformatique, en particulier, de bonnes connaissances sur la structure et la régulation des gènes, des connaissances de base sur l’édition du génome avec le système CRISPR-Cas9, codage en python, html, ligne de commandes Linux, anglais courant indispensable.


Contraintes et risques :