Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
La mission du chercheur consistera à concevoir des bio-épurateurs enzymatiques capables de neutraliser des toxines de petites molécules. Il utilisera des outils de (re)conception de protéines basés sur l’intelligence artificielle et validera expérimentalement les conceptions par cristallographie des protéines.
Activités :
- Développement d’un pipeline pour la conception de protéines à l’aide de logiciels existants, incluant des outils de génération de repliements, de génération de séquences et de prédiction de structures, complétés par des mesures de validation in silico.
- Application du pipeline pour (re)concevoir des bio-épurateurs enzymatiques ciblant des toxines spécifiques, incluant la création de protéines de novo ainsi que la modification de sites actifs d’enzymes existantes.
- Cristallographie des protéines pour valider le repliement et la liaison aux composés toxiques.
- Rédiger des protocoles et des articles de recherche, et diffuser les travaux lors de conférences.
- Les activités supplémentaires incluent la présentation des résultats de recherche au sein du groupe de recherche et du consortium de recherche ; la contribution à la vie en commun du groupe ; l’aide à la supervision de stagiaires ; et la participation aux événements scientifiques de l’institut.
Contexte de travail :
Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l’Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d’envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s’appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu’unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l’IBS est composé de 20 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 320 personnes y travaillent chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée intègrera le groupe DYNAMOP (https://www.ibs.fr/en/research/assembly-dynamics-and-reactivity/dynamics-and-kinetics-of-molecular-processes-group-m-weik/), qui étudie la structure et la dynamique des protéines par diffraction et diffusion des rayons X (statique et résolue en temps), ainsi que par spectroscopie neutronique. Le groupe DYNAMOP comprend deux équipes, dont l’équipe Serial NanoCrystallography (SNaX) qui se concentre sur la cristallisation in vivo, la cristallographie sérielle, développement d’outils pour la cristallographie aux rayons X résolue en temps (NanoPeakCell et Xtrapol8). Elle a récemment intégré des lignes de recherche en con
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Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
- Doctorat en bio-informatique, biophysique, biochimie, biologie, physique, chimie, mathématiques, informatique ou domaine connexe.
- Expérience en programmation (Python ou autre langage informatique).
- Publications avérées dans des revues scientifiques à comité de lecture.
- Niveau d’anglais (écrit/oral) minimum B2 (selon le cadre européen commun de référence pour les langues).
- Grande capacité d’autonomie.
- Sens de la communication (écrite et orale) et capacité à collaborer efficacement avec les membres de l’équipe.
- Une expérience dans un ou plusieurs des domaines suivants serait un atout : conception de protéines ou utilisation de l’intelligence artificielle pour la biologie structurale ; expression et purification de protéines ; cristallisation de protéines et cristallographie macromoléculaire.
Contraintes et risques :
- Le poste proposé s’inscrit dans un projet de recherche en lien avec la sécurité nationale. De ce fait, la personne recrutée devra respecter l’ensemble des critères définis dans la convention de financement du projet.
- La recherche se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.