L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multiperformantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

• Vous serez accueilli(e) au sein du CIRM-CFBP, dans l’unité IRHS

Le CIRM-CFBP (Collection Française des Bactéries associées aux Plantes ; https://cirm-cfbp.fr) est un centre de ressources biologique qui préserve des ressources stratégiques pour la santé des plantes. Cette collection est intégrée à l'équipe EmerSys de l'unité IRHS, Institut de Recherche en Horticulture et Semences (https://irhs.angers-nantes.hub.inrae.fr/). 

Le CIRM-CFBP développe actuellement des projets autour de la conservation des microbiotes. Dans ce cadre, le CIRM-CFBP est partenaire du projet MICROBE. Ce projet Européen (HORIZON-INFRA-2022-TECH-01-01; www.microbeproject.eu) a pour ambition de développer des techniques et des standards pour permettre aux centres de ressources biologiques de préserver de manière fiable et efficace des communautés complexes de microorganismes (ou microbiotes). Le CIRM-CFBP sera en charge de mettre au point et valider des techniques de préservation et d'analyse de la qualité des microbiotes associés aux semences. Afin de mener à bien ce projet, le CIRM-CFBP recrute un assistant ingénieur pour une durée d’environ 2 ans à partir de Septembre 2024.

• Vous serez plus particulièrement en charge de : 

La personne recrutée aura en charge de : 

--> Participer à la conception d’expérimentations 

Les questions explorées sont centrées autour de la détermination des meilleurs protocoles pour conserver les microbiotes ; quels sont les meilleurs protocoles pour la multiplication et la distribution des microbiotes ; comment efficacement conserver et/ou préparer des communautés microbiennes syntétiques. 

Participer à l’étude bibliographique, établissement des protocoles, test des expérimentations. 

--> Mettre en œuvre les expérimentations qui auront lieu dans le cadre du projet MICROBE au 

CIRM-CFBP, IRHS. Plus particulièrement il s’agira de Microbiologie : 

- Tester diverses techniques de conservation des microbiotes 

- Mesurer des activités métaboliques en utilisant la technologie Biolog Biologie moléculaire 

- Réaliser des analyses de métabarcoding (extraire les ADN, préparer les librairies et réaliser 

le séquençage par la méthode Illumina) et obtenir les données. 

--> Participer à l’analyse des résultats Analyse des données sous R 

Mise en forme des résultats pour discussion et présentation 

Communication avec les membres de l’équipe et les membres du consortium en Français et en Anglais.

• Formation recommandée : Bac +3 à Bac +5
• Connaissances souhaitées : Microbiologie, Biologie moléculaire, Ecologie microbienne, Recherche bibliographique, Bonnes Pratiques de Laboratoire
• Expérience appréciée : Microbiologie, Biologie Moléculaire, Métabarcoding, Analyses R
• Aptitudes recherchées : Curiosité, Motivation, Travail en Equipe, Autonomie, Organisation, Adaptation, Initiative, Dynamisme, Maitrise de l’anglais (écrit/oral) indispensable.

En rejoignant INRAE, vous pourrez bénéficier selon le type de contrat : 

• jusqu’à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
• d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
• de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
• d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
• de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
• d'activités sportives et culturelles ;
• d'une restauration collecti