L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 268 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

L'unité GenPhySE (Génétique, Physiologie et Système d'Elevage) est une unité mixte de recherche du centre INRAE-Occitanie Toulouse. Elle regroupe environ 140 agents titulaires et une centaine de non titulaires par an, sous 3 tutelles, INRAE (via le département de Génétique Animale et le département de Physiologie Animale et Systèmes d'Elevage), l'Institut National Polytechnique de Toulouse et l'Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse. L'activité scientifique de GenPhySE est dédiée à faire évoluer les systèmes de production animale par des innovations génétiques, nutritionnelles et de conduite d'élevage, dans une perspective de production durable.

GenPhySE compte 10 équipes de recherche dont l'équipe GenEpi (Génétique et Epigénétique moléculaires des espèces animales utilisées en croisement). La thématique centrale de l'équipe GenEpi est l'identification et la caractérisation des gènes expliquant la variabilité des caractères observée chez les animaux domestiques (porc, lapin, caille). L'évolution constante des technologies de séquençage requiert la mise au point de protocoles de biologie moléculaire pour fournir des échantillons biologiques de bonne qualité et en quantité suffisante. En parallèle, les programmes d'amélioration génétique et épigénétique nécessitent le traitement de plusieurs milliers d'échantillons de natures différentes.

POSTE OUVERT AUX AGENTS DES 3 FONCTIONS PUBLIQUES, TITULAIRES OU CDI

Vous serez en charge de la mise en place d'une démarche automatisée pour le traitement des échantillons biologiques qui sont la base de tous les programmes de recherche de l'équipe d'accueil. Ces programmes s'appuient sur des protocoles expérimentaux à partir desquels une variété d'échantillons biologiques est exploitée sous forme d'échantillons moléculaires (ADN et ARN). Ces échantillons moléculaires sont ensuite utilisés via des technologies haut-débit de pointe sur des plateformes de séquençage et de génotypage. Ainsi, l'activité de préparation et de gestion des échantillons (extraction, contrôle qualité, traçabilité) est une activité centrale de l'équipe afin de garantir la qualité et la fiabilité des résultats scientifiques qui en découlent.

 C'est dans cet environnement que vous exercerez votre activité de technicienne / technicien biologiste en génomique/transcriptomique animale. Vous contribuerez et serez intégré-e aux projets scientifiques de l'équipe en travaillant en lien direct avec les différents membres de l'équipe (scientifiques responsables des projets, ingénieurs et personnels techniques). Votre mission principale sera de procéder, pour l'équipe, à la préparation des échantillons biologiques différents dont la nature va encore se diversifier au cours de temps.

A votre arrivée, vous aurez en charge la réalisation, l'optimisation jusqu'à l'automatisation de protocoles d'extractions d'acides nucléiques chez les espèces porcine, aviaire et cunicole. A moyen terme, vous vous investirez dans la préparation robotisée des librairies pour le séquençage haut-débit. Une part de votre activité sera dédiée à la traçabilité et la gestion des métadonnées afin de répondre aux principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).

Vos activités consisteront à

• La collecte, réception et gestion des prélèvements biologiques d'intérêt collectif
• La préparation technique et logistique des échantillons d'ADN et d'ARN
• La préparation des librairies de séquençage
• La réalisation des contrôles qualité impliqués dans tous les protocoles
• L'interprétation critique des résultats techniques obtenus
• La responsabilité de la traçabilité des échantillons
• La mise en place et la validation de processus d'automatisation (extractions, dosages, dilutions, ...)

Participation à la collecte d'échantillons biologiques en élevages

Diplôme réglementaire minimum exigé :

     - IV Baccalauréat, BP, BT

La personne recrutée devra avoir une formation dans le domaine de la biologie moléculaire, ou des sciences et techniques de laboratoire, avec une affinité pour les filières animales.

Une formation en expérimentation animale niveau applicateur sera planifiée la première année.

POSTE OUVERT AUX AGENTS DES 3 FONCTIONS PUBLIQUES, TITULAIRES OU CDI

Lien vers le dossier de candidature :

https://jobs.inrae.fr/mobilite/campagne-annuelle-mobilite/camob23-tr-ga-6