Informations générales
Organisme de rattachement
INSERM
Référence
2023-1363858
Date de début de diffusion
12/10/2023
Date de parution
12/10/2023
Intitulé long de l'offre
Ingénieur-e d'études en bioinformatique
Date limite de candidature
12/11/2023
Employeur
L'Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l'ensemble du territoire.
Nature du contrat
CDD de 2 ans
Description du poste
Versant
Fonction Publique de l'Etat
Catégorie
Catégorie A (cadre)
Nature de l'emploi
Emploi ouvert uniquement aux contractuels
Domaine / Métier
Recherche - Experte / Expert en production, traitement et analyse de données
Statut du poste
Vacant
Intitulé du poste
Ingénieur-e d'études en bioinformatique
Descriptif de l'employeur
L’Inserm est le seul organisme public français entièrement dédié à la recherche biologique, médicale et en santé des populations. Il dispose de laboratoires de recherche sur l’ensemble du territoire, regroupés en 12 Délégations Régionales. Notre institut réunit 15 000 chercheurs, ingénieurs, techniciens et personnels administratifs, avec un objectif commun : améliorer la santé de tous par le progrès des connaissances sur le vivant et sur les maladies, l’innovation dans les traitements et la recherche en santé publique.
Rejoindre l’Inserm, c’est intégrer un institut engagé pour la parité et l’égalité professionnelle, la diversité et l’accompagnement de ses agents en situation de handicap, dès le recrutement et tout au long de la carrière. Afin de préserver le bien-être au travail, l’Inserm mène une politique active en matière de conditions de travail, reposant notamment sur un juste équilibre entre vie personnelle et vie professionnelle.
L'Inserm a reçu en 2016 le label européen HR Excellence in Research et s'est engagé à faire évoluer ses pratiques de recrutement et d'évaluation des chercheurs.
Descriptif du service
Le poste est à pourvoir au sein de l'Institut de Médecine Régénérative et de Biothéraphies (IRMB).
http://www.irmb-inserm.fr/
4 équipes de recherche, 150 personnels, 6 plateformes technologiques, 2 infrastructures nationales
Description du poste
La personne recrutée aura pour mission le développement et les analyses bio-informatiques en lien avec les objectifs du projet CIRCOMA.
Activités principales :
· Gestion des données brutes issues du RNAseq (illumina, oxford nanopore) du projet CIRCOMA,
· Test des pipelines existants et adaptation/développement de nouveaux composants/pipelines d'analyse des ARNs circulaires en fonction des problématiques en lien avec le projet,
· Participation aux analyses de routine des données de séquençage haut-débit incluant des analyses différentielles de gènes, la recherche de mutations et de transcrits de fusion,
· Maintien et développement des outils d’analyse bioinformatiques en lien avec le projet et spécifiquement les approches par kmers,
· Participation à l'animation du réseau CIRCOMA, réunions du consortium (fréquence de 3 réunions annuelles),
· Rédaction des rapports et procédures, rédaction de publications,
· Encadrement des stagiaires.
Conditions particulières d'exercice
· Placé-e sous la responsabilité scientifique du partenaire du projet à Montpellier, en coordination avec le porteur du projet à Toulouse, l’ingénieur-e travaillera en lien étroit avec la bioinformaticienne de l'équipe de Toulouse, pour les aspects techniques et les développements bioinformatiques,
· Validation des données par des expériences fonctionnelles en interactions avec chercheurs, post-doctorants et étudiants en thèse,
· Interaction avec l'ensemble des équipes, chercheurs, ingénieurs, doctorants du projet CIRCOMA pour mettre en partage les outils et pipelines, développer, définir les procédures d'échange, de partage et de sécurité.
Descriptif du profil recherché
Connaissances :
· Connaissances en biologie moléculaire
· Connaissances en Statistiques
· Connaissances en bioinformatique
· Connaissance du Logiciel R, et/ou autre langage de programmation
Savoir-faire :
· Analyse et exploration de données haut débit (RNA-seq),
· Synthèse de ses résultats de recherche et les présenter,
· Gestion de projet,
· Rédaction en anglais.
Aptitudes :
· Capacité d’échange
· Bonne communication
· Esprit d’initiative
Expérience souhaitée : débutants acceptés
Diplôme demandé : Licence ou Master en Bioinformatique
Temps plein
Oui
Rémunération contractuels (en € brut/an)
A partir de 29 352 € par an
Informations complémentaires
Informations complémentaires
· Temps plein
· Nombre d’heures hebdomadaires : 38h30
· Congés Annuels et RTT : 44 jours
· Éléments complémentaires de rémunération :
- Restauration collective,
- Participation à la mutuelle,
- Participation aux frais de transport,
- Supplément Familial de Traitement,
- Indemnités de Télétravail.
Télétravail possible
Oui
Management
Non
Pays
Localisation du poste
Europe, France, Occitanie, Hérault (34)
Lieu d'affectation (sans géolocalisation)
IRMB U1183 – 80 Avenue Augustin Fliche – 34295 MONTPELLIER Cedex 5
Critères candidat
Niveau d'études / Diplôme
Niveau 6 Licence/diplômes équivalents
Spécialisation
- Formations générales
- Spécialités pluriscientifiques
- Chimie-biologie, biochimie
- Sciences naturelles (biologie-géologie)
- Mathématiques
- Sciences de la vie
- Informatique, traitement de l'information, réseau de transmission des données
Niveau d'expérience min. requis
Débutant
Langues
Anglais (Avancé ou indépendant)
Documents à transmettre
L'envoi du CV et d'une lettre de motivation est obligatoire
Demandeur
Date de vacance de l'emploi
02/01/2024
Mail à qui adresser les candidatures (bouton postuler)
Therese.Commes@inserm.fr
Contact 1
Therese.Commes@inserm.fr