Mission principale:

·     Expertise et analyse intégrative de données bioinformatiques liées aux expériences multiomiques incluant principalement la génomique (Whole Exome et Genome Sequencing incluant le séquençage long read, la cartographie optique du génome) et la transcriptomique (RNAseq et ses variantes telles que scRNAseq, Nascent RNAseq) mais également d’autres Omiques comme la protéomique (CHIP-seq, Cut&Run, Cut&Tag, CLIP, Nanostring ect…) appliquées aux maladies rares

·     Développement d’outils bioinformatiques dans le domaine de la génomique (et particulier pour le NGS) et la transcriptomique notamment. Conduite de la maîtrise d’œuvre des projets de développement et d’amélioration continue des outils

·     Analyse en première intention des données générées

·     Encadrement d’étudiants ou de stagiaires

·     Formation des utilisateurs

Activités principales:

·     Piloter le projet de la conception à la réalisation et la mise en œuvre des applications bioinformatiques

·     Assurer la conception de la solution au moyen d’expertises approfondies

·     Analyser les besoins et constituer le cahier des charges fonctionnel du projet

·     Conduire le déploiement d'une application bioinformatique

·     Assurer la veille technologique en relation avec le domaine d'application et les experts du domaine

·     Réaliser l’analyse de données issues de experiences multiomique (WGS, RNAseq…)

·     Diffuser et valoriser les résultats sous forme de rapports techniques, de publications ou de présentations orales auprès des communautés professionnelles et scientifiques

·     Gérer l’ensemble des moyens humains techniques et financiers alloués aux dispositifs de collecte et de traitement de données.

·     Former, en interne et en externe, aux principes et à la mise en œuvre des techniques de l’analyse des données biologiques.

·     Animer des réseaux professionnels d'échange de compétences

·     Orienter et conseiller les utilisateurs pour la mise en œuvre des méthodes d'études et d'interprétation des résultats

·     Conduire les travaux de réception en définissant des jeux tests ou en utilisant ceux fournis par les demandeurs

·     Définir l’architecture matérielle et logicielle en prenant en compte l'environnement existant

·     Valider les différentes documentations produites (développeur, utilisateur et d'exploitation...)

·     Assurer la promotion et la valorisation du logiciel développé

·     Concevoir et animer des actions de formation pour les utilisateurs

·     Organiser la veille scientifique et technologique

Connaissances:

·     Connaissance approfondie des méthodes d’analyse et de traitement des données

·     Connaissance approfondie des logiciels appropriés

·     Connaissance générale dans le domaine des sciences de la vie

·     Connaissance de la déontologie, l’éthique, la loi et la réglementation en recherche biomédicale

Savoir-faire:

·     Coordonner et planifier les différentes phases d'un protocole de recherche

·     Travailler en interaction avec des bioinformaticiens, des biologistes et des informaticiens

·     Garantir la qualité et la pertinence des outils d’analyse et des résultats (choix cohérent d’outils mathématiques, statistiques et informatiques adaptés au traitement des données)

·     Veiller au bon déroulement des démarches administratives légales ou réglementaires

·     Maîtriser les techniques de présentation (écrites et orales) et d’animation de réunions

·     Maîtriser les méthodes de la conduite de projet

·     Maîtriser les méthodes et techniques de programmation

·     Intégrer des matériels et logiciels propres à une technologie avancée

 
Aptitudes:

·      Avoir l’esprit d’équipe

·     Sens de la pédagogie

·     Travailler en autonomie

·     Être rigoureux

·     Capacité d’adaptation

·     Maîtrise de l’anglais écrit

Expérience(s) souhaité(s)
·    3 à 5 d’expérience sur poste similaire apprécié
·     Bac + 5 minimum en bioinformatique