Le Centre national de la recherche scientifique est un organisme public de recherche pluridisciplinaire placé sous la tutelle du ministère de l’Enseignement supérieure et de la Recherche. Créé en 1939 et dirigé par des scientifiques, il a pour mission de faire progresser la connaissance et être utile à la société dans le respect des règles d’éthique, de déontologie et d’intégrité scientifique.

Missions :
Développer et utiliser des pipelines bioinformatiques pour nettoyer et analyser des génomes bactériens, et leurs lien avec des phénotypes hôtes notamment épidémiologiques (contenu en gènes, inférence phylogénétique, analyses de pangénomes, identification de SNPs, étude d'association, etc.)
Communiquer les résultats à des conférences scientifiques.
Publier les résultats dans des journaux scientifiques.
Activités :
- Analyser des données génomiques bactériennes
- Présenter des résultats à des conférences scientifiques
- Ecrire des publications scientifiques pour communiquer les résultats
Contexte de travail :
Le postdoctorant rejoindra deux groupes de recherche : l'un au Quartier Latin au centre de Paris (Centre Interdisciplinaire de Recherche en Biologie, UMR CNRS 7241, Collège de France) spécialisé dans les modèles mathématiques pour étudier l'évolution, l'autre sur le campus de la Faculté de Médecine Bichat à le Nord de Paris (Infection, Antimicrobiens, Modélisation, Evolution, UMR INSERM 1137) spécialisé en écologie & évolution des maladies infectieuses. Ces groupes offrent des opportunités de collaborations avec des mathématicens, des bioinformaticiens, des médecins et des biologistes.

Le Centre national de la recherche scientifique est l’une des plus importantes institutions publiques au monde : 34 000 femmes et hommes (plus de 1 000 laboratoires et 200 métiers), en partenariat avec les universités et les grandes écoles, y font progresser les connaissances en explorant le vivant, la matière, l’Univers et le fonctionnement des sociétés humaines. Depuis plus de 80 ans, y sont développées des recherches pluri et interdisciplinaires sur tout le territoire national, en Europe et à l’international. Le lien étroit que le CNRS tisse entre ses missions de recherche et le transfert vers la société fait de lui un acteur clé de l’innovation en France et dans le monde. Le partenariat qui le lie avec les entreprises est le socle de sa politique de valorisation et les start-ups issues de ses laboratoires (près de 100 chaque année) témoignent du potentiel économique de ses travaux de recherche.

Competences :
Expérience en génomique et bioinformatique.
Expérience ou intérêt fort pour étudier l'évolution de génomes bactériens.
Bonnes compétences quantitatives.
Contraintes et risques :
-